跨境電商在台無固定營業場所、年銷售額逾48萬元，5月1日開始須登記稅籍並報繳營業稅。由於進口勞務的營業稅納稅義務人由買受人轉變為境外電商，因此可能將5%營業稅轉嫁給消費者。
現行國內電商業者銷售勞務的價格如線上遊戲點數等，其中已含有5%的營業稅，國內營業人會代為繳納。而國外電商業者修法前為逆向課稅是由買受人繳納，考量稽徵成本，進口勞務3,000元以下免繳營業稅。
但境外電商在新法上路後，因過去進口勞務的納稅義務人由買受人（消費者）自行報繳，改為與國內業者相同規範，由境外電商業者報繳，此次修法也取消3,000元門檻，也因此部分境外電商業者可能將5%營業稅轉嫁於消費者身上。
據悉，亞馬遜雲端服務 AWS為配合新制，將在未來向個人使用者客戶調高5%價格繳交營業稅，不過若是公司或法人客戶，則不在這次調漲費用的範圍內。
財政部官員表示，是否漲價轉嫁5%營業稅，業者各有其經營策略，的確可能調漲，但也有些電商並未調漲。觀察過去在境外電商消費勞務者，多數在3,000元以下，以購買音樂串流服務或是遊戲點數為大宗，影響範圍或金額應該不會太大。
境外電商從5月開始，只要年銷售額超過48萬元就須辦理稅籍登記，且不論有無銷售額均應申報，每兩個月為一期，於下月15日內報繳營業稅。舉例來說，5月~6月銷售額應在7月1日至15日間申報，而報繳營業稅額的匯率，以申報所屬期間末日為準計算，也就是6月30日的匯率來換算應繳納稅額。
東吳會計系副教授楊葉承表示，平常消費者在國內購買勞務也要負擔5%的營業稅，跨境電商銷售勞務過去都沒有負擔，現在比照國內廠商繳納符合租稅公平，對消費者影響應該不大。同時，國稅局也不用擔心逃漏稅問題，由於多數消費者購買勞務多採用信用卡，在金流追蹤下相對容易認定。
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